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circRNA研究汇总 | 20190812-0818

木禾 circRNA 2021-02-21

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欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献22篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。


1、circOSBPL10鉴定为胃癌中的致癌因子和预后标志物的研究

论文标题:Circular RNA profile identifies circOSBPL10 as an oncogenic factor and prognostic marker in gastric cancer

期刊:Oncogene  

影响因子:6.634

通讯作者:徐泽宽教授(南京医科大学第一附属医院)


胃癌根治性切除术后的预后仍然不能令人满意,因此,寻找新的可替代分子和遗传靶标的治疗方法的发展至关重要。环状RNA(circRNA)作为新发现的分子,在非编码RNA调控网络中具有关键作用,已被确定为各种癌症的关键调节因子。该研究中,研究者首先通过circRNA新一代测序分析,筛选到胃癌组织中高表达的环状RNA分子——hsa_circ_0008549,来源于OSBPL10基因并将其命名为circOSBPL10。通过定量RT-PCR鉴定circOSBPL10的表达在GC组织中上调,并且circOSBPL10的沉默在多个实验中显着抑制GC细胞生长,迁移和侵袭。我们进一步证实miR-136-5p是使用RNA下拉和荧光素酶报告基因测定的circOSBPL10的下游靶标。拯救实验证实,circOSBPL10通过circOSBPL10-miR-136-5p-WNT2轴调节GC细胞中的生物学功能。体内实验表明,circOSBPL10促进小鼠的肿瘤生长和转移。此外,观察到circOSBPL10的水平是GC患者的总体存活和无病生存的预后标志物。总之,我们的研究结果表明circOSBPL10可能作为GC中新的增殖因子和预后标志物。


图注:RNA-seq和RT-PCR筛选鉴定到circOSBPL10在胃癌组织和细胞中显著上调


2、在去势抵抗性前列腺癌中环状RNA增加了雄激素受体亚型多样性

论文标题:Circular RNAs add diversity to androgen receptor isoform repertoire in castration-resistant prostate cancer

期刊:Oncogene 

影响因子:6.634

通讯作者: Flemington EK和 Dong Y(杜兰大学医学院)


环状RNA(circRNA)的表达失调与各种人类癌症相关,但人们对转移性去势抵抗性前列腺癌(前列腺癌高死亡率的主要原因)中的circRNA表征仍然有限。该研究中,研究者通过分析外显子组捕获RNA-seq数据集和来自患者的异种移植物(PDX)和细胞模型的ribodepletion-seq和RNase R-seq测序数据,鉴定了13个关键的来自前列腺癌驱动基因-雄激素受体(AR)的circRNA分子。最终验证表达最丰富的前四个circRNAs且临床相关的AR circRNA。这些AR circRNA的表达特异性地在PDX的去势抗性进展期间上调。另外,在临床样品和PDX中AR circRNA的表达水平与线性AR转录物(AR和AR变体)的水平强烈相关,表明存在潜在的转录调控机制。在细胞水平,雄激素抑制了这些AR circRNA和线性AR转录物的表达,并且抑制能力因雄激素抵抗而减弱。使用核/细胞质分离PCR和RNA原位杂交实验测定,发现这些AR circRNA主要定位在细胞质,表明其在细胞质中发挥功能。该研究,首次对AR基因产生的circRNA进行了全面的表征。与线性AR转录物相比AR circRNA耐受RNAaseR酶抗性,具备在患者血浆中检测AR circRNA的可能性,因此,这些AR circRNA可以作为AR/AR-亚型表达和去势抗性前列腺癌进展的新型标志物。


图注:高通量测序实验筛选到AR相关circRNA分子


3、circKDM4C通过调节乳腺癌中的miR-548p/PBLD轴抑制肿瘤进展并减弱阿霉素的耐药性

论文标题:circKDM4C suppresses tumor progression and attenuates doxorubicin resistance by regulating miR-548p/PBLD axis in breast cancer

期刊:Oncogene 

影响因子:6.634

通讯作者:杨其峰教授(山东大学齐鲁医院乳腺外科)


越来越多的证据表明环状RNA(circRNAs)在癌症发展中起着关键作用。然而,只有少数circRNA已通过实验验证和功能注释。在这项研究中,研究者使用circRNA芯片测定筛选到一种新的circRNA——circKDM4C,circKDM4C在具有转移的乳腺癌组织中下调。此外,研究者发现低表达的circKDM4C与乳腺癌预后不良和转移相关。体外体内功能研究结果表明circKDM4C可显著抑制乳腺癌增殖、转移和阿霉素抗性。分子机制研究中,研究者利用双荧光素酶和AGO2 RNA免疫沉淀实验鉴定到circKDM4C可作为miR-548p海绵。miR-548p在乳腺癌中起到抑癌基因的作用,且miR-548p可直接靶向结合PBLD。此外,乳腺癌细胞中miR-548p过表达能够逆转减弱circKDM4C诱导的恶性表型和PBLD表达的升高。该研究结果表明circKDM4C可作为乳腺癌预后生物潜在标志物,circKDM4C/miR-548p/PBLD信号轴可能是靶向治疗乳腺癌的有希望的靶标。


图注:circKDM4C表达水平在乳腺癌组织中显著下调


参考文献列表:



1

2019年度circRNA国家自然科学基金项目汇总

2

以RNase R鉴定或富集circRNA

3

Nature Reviews Genetics | 发表circRNA重要综述

4

circRNA研究汇总 | 20190805-0811

5

研究策略 | 环形RNA的翻译

6

第五届circRNA研究论坛圆满落幕!





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